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核酸提取方法及原理
發(fā)布日期:2023/2/27 17:55:59
核酸(我們常說的DNA/RNA)是核酸檢測的基礎物質,而核酸提取不管是“一步法”還是“兩步法”,目的都是要提取出相當純度的核酸。這也是整個核酸檢測行業(yè)繞不過去的步驟,很多時候一份臨床樣本的核酸提取純度高低,甚至直接決定了檢測結果的有效性。
核酸是由許多核苷酸聚合成的生物大分子化合物,是生命最基本的物質之一。生物體內的核酸常與蛋白質結合形成核蛋白。核酸提取的原則首先保證核酸一級結構的完整性,其次要排除其它分子的污染。
提取核酸時要注意簡化步驟,縮短提取時間;減少化學因素對核酸的降解;減少物理因素對核酸的降解;減少機械剪切力和高溫;防止核酸的生物降解。
核酸提取大致分為3大部分:破碎、提取、純化
常見細胞裂解法
物理方式:煮沸法、玻璃珠法、超聲波法、研磨法、凍融法、勻漿法;
化學方式:表面活性劑(SDS法)、堿裂解法;
生物方法:生物酶,如溶菌酶,蛋白酶K等;
常見樣本提取方法總結
濃鹽法:利用RNA和DNA在鹽溶液中溶解度不同,將二者分離;
有機溶劑提取法:有機溶劑作為蛋白變性劑,同時抑制核酸酶的降解作用;
高度梯度離心法:利用不同內容物密度不同的原理分離各種內容物;
吸附材料結合法:①硅質材料 高鹽低PH值結合核酸,低鹽高PH值洗脫;②陰離子交換樹脂 低鹽高PH值結合核酸,高鹽低PH值洗脫;③磁珠 磁珠微粒包裹上不同基因可吸附不同的目的物,從而達到分離目的;
現(xiàn)在一般有手工提取和儀器自動提取兩種方式,手工提取如:酚/氯仿抽提法、醇沉淀法、層析柱法、熱裂解堿法、煮沸裂解法等。儀器提取就是我們現(xiàn)在市場上大面積推廣的核酸提取儀,通常基于磁珠法,這也是現(xiàn)階段和未來二三級醫(yī)院需求面很廣的儀器。
核酸提取純化原則和要求
1、保證核酸一級結構的完整性;
2、排除其它分子的污染(如提取DNA時排除RNA的干擾);
3、核酸樣品中不應存在對酶有抑制作用的有機溶劑和高濃度的金屬離子
4、盡可能降低蛋白質、多糖和脂類等大分子物質;
核酸提取純化方法總結
1、酚/氯仿抽提法
通過酚/氯仿處理細胞破碎液或者組織勻漿后,在水相中主要溶解以DNA為主的核酸成分,在有機相中主要是脂類物質,蛋白質位于兩相之間。
2、醇沉淀法
乙醇能夠消除核酸的水化層,使帶負電荷的磷酸基團暴露出來,Na之類的平衡離子能夠與這些帶電基團結合,在沉淀形成部位降低多核苷酸鏈之間的排斥作用,形成沉淀。
3、過柱法
通過特殊硅基質吸附材料,能夠特定吸附DNA,然后利用高鹽低PH結合核酸,低鹽高PH值洗脫,來分離純化核酸。
4、熱裂解堿法
堿裂解法是基于DNA的變性與復性差異而達到分離目的的。堿性使質粒DNA變性,再將pH值調至中性使其復性,復性的為質粒DNA,而染色
體DNA不會復性,纏結成網狀物質,通過離心除去;
5、煮沸裂解法
加熱處理DNA溶液時,線狀染色體DNA容易發(fā)生變性,共價閉合的質粒DNA在冷卻時即恢復其天然構象;變性染色體DNA片段與變性蛋白質和細胞碎片結合形成沉淀,而復性的超螺旋質粒DNA分子則以溶解狀態(tài)存在液相中,從而可通過離心將兩者分開。煮沸裂解法提取DNA,得量少,雜質多,DNA可能會出現(xiàn)斷裂,主要適用于一些粗略的實驗。
6、磁珠法
對超順磁性納米顆粒的表面進行改良和表面修飾后,制備成超順磁性氧化硅納米級磁珠。該磁珠能與核酸分子特異性結合。利用氧化硅納米微球的超順磁性,在Chaotropic鹽(鹽酸胍、異硫氰酸胍等)和外加磁場的作用下,從血液、動物組織、食品、病原微生物等樣本中分離出DNA和RNA。
7、CTAB法原理(植物DNA提取經典方法)
CTAB(hexadecyltrimethylammoniumbromide,十六烷基三甲基溴化銨),是一種陽離子去污劑,具有從低離子強度溶液中沉淀核酸與酸性多聚糖的特性。在高離子強度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB與蛋白質和多聚糖形成復合物,只是不能沉淀核酸。通過有機溶劑抽提,去除蛋白、多糖、酚類等雜質后加入乙醇沉淀即可使核酸分離出來。
8、其他方法

除了上述常用的方法之外,還有超聲法、酶解法及濃鹽法等等多種方法。

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