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I級生物安全柜根據使用HEPA進行過濾，定向培養和層流氣流為客戶/操作工，環境和產品/試品給予維護。出自于無菌的目的，相對于尺寸為0.3微米的顆粒，HEPA過濾器一般而言額定容量為99.99+％。
非常典型的微生物程序流程一般而言充分利用本生燈燃燒器或其他的明火來消毒殺菌和/或降低交叉環境污染。
考慮到以下幾個原因，提議不要在安全柜內使用這樣的明火：
（1）II類生物安全柜根據將層流（以恒定速度-無湍流的單向流動的空氣量）由上向下傳遞到機柜的工作任務地區，根據明火加熱氣體來維護產品維護導致氣體逆著層流下降而上升，導致湍流;進而消除產品維護。
（2）明火也有著熔化將HEPA進行過濾介質固定在其結構上的粘合劑的工作能力。這影響了HEPA過濾器的實效性，進而導致正壓通風口中的容器損害。
（3）后，假如火焰滅掉，閥門不關上，易燃氣體會以平穩的速度流入柜體。相對于A2中生物安全柜中70％的氣體被再次循環的情況，易燃氣體的濃度很有可能會爆炸，而且不僅對生物安全柜導致嚴重危害，而且對使用者和實驗室導致嚴重危害。
疾病控制和預防中心（CDC）和國家衛生研究院（NIH）在該出版物中也提到了這一點：
在生物安全柜工作任務時，能夠采取各種措施來降低材料交叉環境污染的可能性。開啟的管子或瓶子不應豎直放置。科學研究人員使用陪替氏培養皿和組織培養板時應將蓋子放到開放的無菌表面上方，以盡量避免由上向下氣體的直接沖擊。
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